MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 13047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017061	T	7	7	13	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017061	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017061	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017061	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017061	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017061	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017061	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017061	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017061	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017061	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017061	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017061	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017061	AT	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017061	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017061	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017061	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017061	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017061	T	6	6	3160	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017061	AT	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017061	T	6	6	6822	6827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017061	CTA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017061	ATT	2	6	6968	6973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017061	T	7	7	6995	7001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017061	TAT	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017061	A	7	7	9512	9518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017061	GAT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017061	TGT	2	6	9557	9562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017061	A	7	7	9601	9607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017061	GA	3	6	9654	9659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017061	CAA	2	6	9662	9667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017061	TAAA	2	8	9718	9725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017061	AGTC	2	8	9744	9751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017061	ACT	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017061	GGC	2	6	9797	9802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017061	GCG	2	6	9857	9862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017061	CCTG	2	8	9887	9894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017061	CGA	2	6	10042	10047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017061	GCA	2	6	10116	10121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017061	CGC	2	6	10163	10168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017061	GTGA	2	8	10169	10176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017061	TGT	2	6	10202	10207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017061	GAA	2	6	10212	10217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017061	GGC	2	6	10236	10241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017061	CAG	2	6	10285	10290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017061	ATT	2	6	10326	10331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017061	AGA	2	6	10426	10431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017061	GGA	2	6	10476	10481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017061	CT	3	6	10501	10506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017061	GAG	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017061	TGC	2	6	10621	10626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017061	GAA	2	6	10740	10745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017061	GGT	2	6	10814	10819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017061	GTC	2	6	10828	10833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017061	TCGTG	2	10	10837	10846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017061	GGA	2	6	10940	10945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017061	ATC	2	6	10964	10969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017061	AC	3	6	10991	10996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017061	AC	3	6	11160	11165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017061	CAC	2	6	11175	11180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017061	AGCC	2	8	11223	11230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017061	GAT	2	6	11246	11251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017061	CCT	2	6	11302	11307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017061	GGT	2	6	11459	11464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017061	CCA	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017061	AGG	2	6	11541	11546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017061	CCA	2	6	11571	11576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017061	GGACG	2	10	11712	11721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017061	AAGC	2	8	11748	11755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017061	CAC	2	6	11787	11792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017061	GGA	2	6	11872	11877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017061	GCG	2	6	11906	11911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017061	AGG	2	6	12024	12029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017061	TC	3	6	12056	12061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017061	CGG	2	6	12080	12085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017061	GGA	2	6	12112	12117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017061	AGT	2	6	12233	12238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017061	AGA	2	6	12314	12319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017061	CACG	2	8	12444	12451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017061	TC	3	6	12517	12522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017061	AGC	2	6	12775	12780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017061	TTC	2	6	12873	12878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017061	ACC	2	6	13101	13106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017061	G	6	6	13126	13131	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017061	AGG	2	6	13136	13141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017061	GCGA	2	8	13232	13239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017061	TAG	2	6	13244	13249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017061	GAG	2	6	13331	13336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017061	GA	3	6	13354	13359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017061	GA	3	6	13433	13438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017061	CGG	2	6	13591	13596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017061	GA	3	6	13689	13694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017061	TAGG	2	8	13807	13814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017061	TAC	2	6	13861	13866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017061	CGC	2	6	13891	13896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017061	CGGG	2	8	13903	13910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017061	CCT	2	6	13949	13954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017061	GGT	2	6	14085	14090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017061	CGT	2	6	14280	14285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017061	GAG	2	6	14329	14334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017061	GTT	2	6	14383	14388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017061	C	6	6	14456	14461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_017061	GAT	2	6	14507	14512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017061	ATCG	2	8	14568	14575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017061	GA	3	6	14620	14625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017061	TGG	2	6	14641	14646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017061	CGC	2	6	14744	14749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017061	T	6	6	14791	14796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017061	CCTTT	2	10	15764	15773	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017061	ATA	2	6	15837	15842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017061	A	6	6	17348	17353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017061	T	8	8	17382	17389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017061	TGT	2	6	17415	17420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017061	TTTGAA	2	12	17423	17434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017061	ATGA	2	8	17467	17474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017061	AAGA	2	8	18826	18833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017061	TGA	2	6	18838	18843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017061	A	6	6	18873	18878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017061	ATT	2	6	18883	18888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017061	A	7	7	18892	18898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017061	ATCT	2	8	18903	18910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017061	CT	3	6	20598	20603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017061	AG	3	6	20609	20614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017061	GTG	2	6	20622	20627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017061	T	6	6	20795	20800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017061	GTT	2	6	20824	20829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017061	ATA	2	6	23382	23387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017061	GAAAT	2	10	23411	23420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017061	A	6	6	23421	23426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017061	TAT	2	6	23466	23471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017061	GGA	2	6	23485	23490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017061	TCC	2	6	23568	23573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017061	AT	3	6	23608	23613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017061	T	6	6	23651	23656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017061	A	7	7	23663	23669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017061	TCC	2	6	24988	24993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017061	TA	3	6	25026	25031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017061	A	6	6	25060	25065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017061	TA	3	6	26358	26363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017061	TGAA	2	8	26368	26375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017061	CCT	2	6	26381	26386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017061	A	6	6	26411	26416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017061	CTG	2	6	27000	27005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017061	A	6	6	27038	27043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017061	AAG	2	6	27047	27052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017061	AG	3	6	27051	27056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017061	TG	3	6	27585	27590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017061	CAT	2	6	27591	27596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017061	ATTT	2	8	27623	27630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017061	TAAG	2	8	27729	27736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017061	GGAA	2	8	27791	27798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017061	GCA	2	6	27799	27804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017061	ATCA	2	8	27901	27908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017061	T	6	6	27944	27949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017061	TAA	2	6	27994	27999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017061	ATG	2	6	28002	28007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017061	AGG	2	6	28016	28021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017061	AG	3	6	29732	29737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017061	ATAA	2	8	30075	30082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017061	TCT	2	6	30943	30948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_017061	ACT	2	6	31492	31497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017061	GGC	2	6	31535	31540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017061	CGA	2	6	31780	31785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_017061	GAA	2	6	37631	37636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017061	ATA	2	6	38802	38807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017061	CAA	2	6	48777	48782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_017061	T	8	8	51144	51151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017061	GGA	2	6	51152	51157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_017061	ATG	2	6	52734	52739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017061	AT	3	6	53659	53664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017061	ATT	2	6	53681	53686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017061	AAT	2	6	53755	53760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017061	TTG	2	6	53762	53767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017061	TTA	2	6	53776	53781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017061	TTTTG	2	10	54144	54153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_017061	GGT	2	6	95679	95684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_017061	TGG	2	6	96235	96240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017061	CGG	2	6	96419	96424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_017061	ATA	2	6	97015	97020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017061	CT	3	6	98094	98099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_017061	GAG	2	6	98117	98122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017061	TGC	2	6	98214	98219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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